Protein–RNA interactions for Protein: O88477

Igf2bp1, Insulin-like growth factor 2 mRNA-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igf2bp1O88477 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Igf2bp1O88477 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Igf2bp1O88477 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Igf2bp1O88477 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Igf2bp1O88477 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Igf2bp1O88477 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Igf2bp1O88477 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Igf2bp1O88477 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Igf2bp1O88477 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Igf2bp1O88477 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Igf2bp1O88477 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Igf2bp1O88477 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Igf2bp1O88477 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Igf2bp1O88477 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Igf2bp1O88477 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Igf2bp1O88477 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Igf2bp1O88477 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Igf2bp1O88477 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Igf2bp1O88477 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Igf2bp1O88477 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Igf2bp1O88477 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Igf2bp1O88477 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Igf2bp1O88477 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Igf2bp1O88477 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Igf2bp1O88477 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Igf2bp1O88477 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Igf2bp1O88477 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Igf2bp1O88477 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Igf2bp1O88477 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Igf2bp1O88477 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Igf2bp1O88477 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Igf2bp1O88477 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms