Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tnnt1O88346 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tnnt1O88346 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tnnt1O88346 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tnnt1O88346 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tnnt1O88346 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tnnt1O88346 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tnnt1O88346 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tnnt1O88346 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tnnt1O88346 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tnnt1O88346 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tnnt1O88346 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tnnt1O88346 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tnnt1O88346 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tnnt1O88346 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tnnt1O88346 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tnnt1O88346 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tnnt1O88346 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tnnt1O88346 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tnnt1O88346 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tnnt1O88346 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tnnt1O88346 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tnnt1O88346 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tnnt1O88346 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Tnnt1O88346 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Tnnt1O88346 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tnnt1O88346 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tnnt1O88346 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tnnt1O88346 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tnnt1O88346 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tnnt1O88346 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tnnt1O88346 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tnnt1O88346 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Tnnt1O88346 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Tnnt1O88346 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tnnt1O88346 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Tnnt1O88346 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Tnnt1O88346 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tnnt1O88346 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tnnt1O88346 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tnnt1O88346 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnnt1O88346 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnnt1O88346 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnnt1O88346 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnnt1O88346 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnnt1O88346 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnnt1O88346 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnnt1O88346 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tnnt1O88346 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tnnt1O88346 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tnnt1O88346 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tnnt1O88346 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tnnt1O88346 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Tnnt1O88346 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Tnnt1O88346 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms