Protein–RNA interactions for Protein: O75679

RFPL3, Ret finger protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL3O75679 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RFPL3O75679 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RFPL3O75679 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFPL3O75679 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
RFPL3O75679 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RFPL3O75679 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms