Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LGR5O75473 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LGR5O75473 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LGR5O75473 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LGR5O75473 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
LGR5O75473 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LGR5O75473 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LGR5O75473 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LGR5O75473 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LGR5O75473 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LGR5O75473 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LGR5O75473 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LGR5O75473 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LGR5O75473 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LGR5O75473 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LGR5O75473 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LGR5O75473 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LGR5O75473 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LGR5O75473 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LGR5O75473 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LGR5O75473 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LGR5O75473 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LGR5O75473 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LGR5O75473 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LGR5O75473 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LGR5O75473 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LGR5O75473 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LGR5O75473 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LGR5O75473 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LGR5O75473 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LGR5O75473 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LGR5O75473 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LGR5O75473 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LGR5O75473 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LGR5O75473 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LGR5O75473 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LGR5O75473 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LGR5O75473 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
LGR5O75473 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR5O75473 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR5O75473 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR5O75473 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR5O75473 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LGR5O75473 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LGR5O75473 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LGR5O75473 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LGR5O75473 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LGR5O75473 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LGR5O75473 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LGR5O75473 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LGR5O75473 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LGR5O75473 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LGR5O75473 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
LGR5O75473 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LGR5O75473 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LGR5O75473 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LGR5O75473 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LGR5O75473 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LGR5O75473 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LGR5O75473 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LGR5O75473 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LGR5O75473 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LGR5O75473 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LGR5O75473 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LGR5O75473 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LGR5O75473 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LGR5O75473 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LGR5O75473 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LGR5O75473 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
LGR5O75473 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
LGR5O75473 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LGR5O75473 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LGR5O75473 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LGR5O75473 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LGR5O75473 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LGR5O75473 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LGR5O75473 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LGR5O75473 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LGR5O75473 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LGR5O75473 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LGR5O75473 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LGR5O75473 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LGR5O75473 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LGR5O75473 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LGR5O75473 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LGR5O75473 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LGR5O75473 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LGR5O75473 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LGR5O75473 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LGR5O75473 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LGR5O75473 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
LGR5O75473 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LGR5O75473 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LGR5O75473 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LGR5O75473 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LGR5O75473 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LGR5O75473 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LGR5O75473 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LGR5O75473 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LGR5O75473 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms