Protein–RNA interactions for Protein: O75390

CS, Citrate synthase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSO75390 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSO75390 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSO75390 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSO75390 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSO75390 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSO75390 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSO75390 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSO75390 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSO75390 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSO75390 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSO75390 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSO75390 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CSO75390 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSO75390 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSO75390 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSO75390 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSO75390 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSO75390 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSO75390 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSO75390 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSO75390 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSO75390 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CSO75390 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSO75390 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSO75390 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSO75390 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSO75390 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSO75390 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CSO75390 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSO75390 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSO75390 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSO75390 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CSO75390 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CSO75390 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSO75390 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSO75390 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CSO75390 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSO75390 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CSO75390 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CSO75390 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CSO75390 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CSO75390 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSO75390 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CSO75390 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSO75390 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSO75390 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSO75390 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSO75390 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSO75390 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSO75390 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSO75390 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSO75390 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CSO75390 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSO75390 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSO75390 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CSO75390 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSO75390 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSO75390 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSO75390 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CSO75390 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSO75390 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSO75390 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSO75390 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSO75390 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CSO75390 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CSO75390 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSO75390 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CSO75390 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSO75390 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSO75390 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSO75390 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSO75390 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSO75390 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CSO75390 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSO75390 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSO75390 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSO75390 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSO75390 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSO75390 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSO75390 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSO75390 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSO75390 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSO75390 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSO75390 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSO75390 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CSO75390 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSO75390 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSO75390 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSO75390 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSO75390 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSO75390 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSO75390 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSO75390 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSO75390 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSO75390 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSO75390 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSO75390 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSO75390 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSO75390 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSO75390 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms