Protein–RNA interactions for Protein: O75264

SMIM24, Small integral membrane protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM24O75264 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SMIM24O75264 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SMIM24O75264 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM24O75264 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMIM24O75264 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM24O75264 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM24O75264 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM24O75264 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM24O75264 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM24O75264 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMIM24O75264 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM24O75264 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM24O75264 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM24O75264 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms