Protein–RNA interactions for Protein: O75096

LRP4, Low-density lipoprotein receptor-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP4O75096 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP4O75096 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP4O75096 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP4O75096 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRP4O75096 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRP4O75096 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP4O75096 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP4O75096 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP4O75096 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP4O75096 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP4O75096 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP4O75096 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP4O75096 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP4O75096 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRP4O75096 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LRP4O75096 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRP4O75096 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP4O75096 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP4O75096 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRP4O75096 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP4O75096 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP4O75096 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP4O75096 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRP4O75096 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRP4O75096 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRP4O75096 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP4O75096 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP4O75096 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP4O75096 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP4O75096 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP4O75096 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRP4O75096 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP4O75096 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP4O75096 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRP4O75096 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP4O75096 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP4O75096 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP4O75096 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP4O75096 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP4O75096 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRP4O75096 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP4O75096 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP4O75096 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP4O75096 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRP4O75096 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP4O75096 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP4O75096 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP4O75096 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRP4O75096 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRP4O75096 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRP4O75096 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRP4O75096 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRP4O75096 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRP4O75096 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRP4O75096 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRP4O75096 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRP4O75096 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRP4O75096 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRP4O75096 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRP4O75096 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRP4O75096 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRP4O75096 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRP4O75096 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRP4O75096 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRP4O75096 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP4O75096 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP4O75096 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP4O75096 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP4O75096 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP4O75096 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP4O75096 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP4O75096 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP4O75096 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRP4O75096 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP4O75096 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP4O75096 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP4O75096 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP4O75096 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP4O75096 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP4O75096 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP4O75096 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP4O75096 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP4O75096 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP4O75096 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP4O75096 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP4O75096 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP4O75096 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP4O75096 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP4O75096 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP4O75096 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP4O75096 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP4O75096 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP4O75096 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRP4O75096 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRP4O75096 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRP4O75096 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRP4O75096 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRP4O75096 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRP4O75096 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LRP4O75096 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms