Protein–RNA interactions for Protein: O75030

MITF, Microphthalmia-associated transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITFO75030 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MITFO75030 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MITFO75030 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MITFO75030 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MITFO75030 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MITFO75030 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MITFO75030 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MITFO75030 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MITFO75030 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MITFO75030 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MITFO75030 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
MITFO75030 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MITFO75030 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MITFO75030 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MITFO75030 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MITFO75030 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MITFO75030 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MITFO75030 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MITFO75030 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MITFO75030 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MITFO75030 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MITFO75030 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MITFO75030 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MITFO75030 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MITFO75030 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MITFO75030 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MITFO75030 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MITFO75030 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MITFO75030 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MITFO75030 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MITFO75030 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MITFO75030 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
MITFO75030 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MITFO75030 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MITFO75030 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MITFO75030 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MITFO75030 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MITFO75030 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MITFO75030 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MITFO75030 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MITFO75030 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
MITFO75030 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MITFO75030 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MITFO75030 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MITFO75030 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MITFO75030 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MITFO75030 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MITFO75030 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MITFO75030 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
MITFO75030 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MITFO75030 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MITFO75030 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MITFO75030 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
MITFO75030 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MITFO75030 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MITFO75030 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MITFO75030 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MITFO75030 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
MITFO75030 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MITFO75030 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MITFO75030 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MITFO75030 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MITFO75030 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
MITFO75030 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MITFO75030 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MITFO75030 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MITFO75030 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MITFO75030 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MITFO75030 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MITFO75030 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MITFO75030 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MITFO75030 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MITFO75030 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MITFO75030 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MITFO75030 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MITFO75030 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MITFO75030 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MITFO75030 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MITFO75030 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MITFO75030 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MITFO75030 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MITFO75030 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MITFO75030 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MITFO75030 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MITFO75030 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MITFO75030 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MITFO75030 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MITFO75030 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MITFO75030 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MITFO75030 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MITFO75030 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MITFO75030 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MITFO75030 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MITFO75030 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MITFO75030 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MITFO75030 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MITFO75030 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MITFO75030 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MITFO75030 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MITFO75030 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 263 ms