Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NOL3O60936 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NOL3O60936 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NOL3O60936 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOL3O60936 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NOL3O60936 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOL3O60936 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOL3O60936 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOL3O60936 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOL3O60936 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOL3O60936 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOL3O60936 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOL3O60936 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOL3O60936 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOL3O60936 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NOL3O60936 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOL3O60936 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOL3O60936 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOL3O60936 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOL3O60936 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOL3O60936 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NOL3O60936 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOL3O60936 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOL3O60936 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NOL3O60936 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOL3O60936 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOL3O60936 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOL3O60936 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NOL3O60936 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NOL3O60936 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NOL3O60936 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
NOL3O60936 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOL3O60936 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOL3O60936 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOL3O60936 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOL3O60936 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NOL3O60936 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOL3O60936 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOL3O60936 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOL3O60936 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NOL3O60936 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NOL3O60936 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOL3O60936 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOL3O60936 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOL3O60936 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NOL3O60936 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOL3O60936 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOL3O60936 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOL3O60936 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOL3O60936 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOL3O60936 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NOL3O60936 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOL3O60936 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOL3O60936 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NOL3O60936 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOL3O60936 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOL3O60936 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NOL3O60936 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOL3O60936 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NOL3O60936 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOL3O60936 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOL3O60936 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOL3O60936 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOL3O60936 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOL3O60936 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOL3O60936 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOL3O60936 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NOL3O60936 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOL3O60936 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NOL3O60936 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOL3O60936 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOL3O60936 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOL3O60936 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NOL3O60936 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOL3O60936 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOL3O60936 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOL3O60936 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOL3O60936 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NOL3O60936 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOL3O60936 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOL3O60936 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOL3O60936 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOL3O60936 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOL3O60936 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NOL3O60936 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOL3O60936 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOL3O60936 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOL3O60936 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOL3O60936 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOL3O60936 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NOL3O60936 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOL3O60936 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NOL3O60936 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOL3O60936 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NOL3O60936 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOL3O60936 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOL3O60936 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOL3O60936 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOL3O60936 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NOL3O60936 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms