Protein–RNA interactions for Protein: O60739

EIF1B, Eukaryotic translation initiation factor 1b, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF1BO60739 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EIF1BO60739 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF1BO60739 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF1BO60739 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF1BO60739 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EIF1BO60739 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EIF1BO60739 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EIF1BO60739 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF1BO60739 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF1BO60739 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EIF1BO60739 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF1BO60739 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF1BO60739 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EIF1BO60739 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF1BO60739 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF1BO60739 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EIF1BO60739 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
EIF1BO60739 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EIF1BO60739 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EIF1BO60739 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms