Protein–RNA interactions for Protein: O60687

SRPX2, Sushi repeat-containing protein SRPX2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPX2O60687 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPX2O60687 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
SRPX2O60687 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SRPX2O60687 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SRPX2O60687 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms