Protein–RNA interactions for Protein: O60568

PLOD3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD3O60568 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLOD3O60568 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLOD3O60568 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PLOD3O60568 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLOD3O60568 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PLOD3O60568 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLOD3O60568 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLOD3O60568 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PLOD3O60568 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLOD3O60568 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLOD3O60568 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PLOD3O60568 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PLOD3O60568 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms