Protein–RNA interactions for Protein: O60506

SYNCRIP, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCRIPO60506 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SYNCRIPO60506 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNCRIPO60506 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SYNCRIPO60506 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNCRIPO60506 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNCRIPO60506 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNCRIPO60506 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNCRIPO60506 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SYNCRIPO60506 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNCRIPO60506 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNCRIPO60506 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNCRIPO60506 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNCRIPO60506 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SYNCRIPO60506 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNCRIPO60506 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SYNCRIPO60506 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNCRIPO60506 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SYNCRIPO60506 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNCRIPO60506 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNCRIPO60506 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SYNCRIPO60506 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SYNCRIPO60506 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNCRIPO60506 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNCRIPO60506 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNCRIPO60506 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNCRIPO60506 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SYNCRIPO60506 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNCRIPO60506 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNCRIPO60506 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNCRIPO60506 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SYNCRIPO60506 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNCRIPO60506 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNCRIPO60506 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNCRIPO60506 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNCRIPO60506 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SYNCRIPO60506 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SYNCRIPO60506 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNCRIPO60506 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNCRIPO60506 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNCRIPO60506 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SYNCRIPO60506 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SYNCRIPO60506 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYNCRIPO60506 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms