Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SORBS3O60504 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SORBS3O60504 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SORBS3O60504 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SORBS3O60504 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SORBS3O60504 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SORBS3O60504 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SORBS3O60504 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SORBS3O60504 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SORBS3O60504 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SORBS3O60504 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SORBS3O60504 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SORBS3O60504 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SORBS3O60504 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SORBS3O60504 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SORBS3O60504 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SORBS3O60504 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SORBS3O60504 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SORBS3O60504 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SORBS3O60504 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SORBS3O60504 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SORBS3O60504 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SORBS3O60504 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SORBS3O60504 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SORBS3O60504 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SORBS3O60504 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms