Protein–RNA interactions for Protein: O60337

MARCH6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH6O60337 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
MARCH6O60337 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MARCH6O60337 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MARCH6O60337 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MARCH6O60337 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MARCH6O60337 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
MARCH6O60337 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MARCH6O60337 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MARCH6O60337 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
MARCH6O60337 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MARCH6O60337 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MARCH6O60337 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MARCH6O60337 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MARCH6O60337 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
MARCH6O60337 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MARCH6O60337 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MARCH6O60337 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MARCH6O60337 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MARCH6O60337 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MARCH6O60337 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MARCH6O60337 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MARCH6O60337 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms