Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
DHX16O60231 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
DHX16O60231 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
DHX16O60231 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DHX16O60231 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
DHX16O60231 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
DHX16O60231 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DHX16O60231 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DHX16O60231 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DHX16O60231 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DHX16O60231 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DHX16O60231 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DHX16O60231 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DHX16O60231 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
DHX16O60231 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DHX16O60231 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
DHX16O60231 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DHX16O60231 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DHX16O60231 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DHX16O60231 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
DHX16O60231 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DHX16O60231 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
DHX16O60231 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
DHX16O60231 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
DHX16O60231 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DHX16O60231 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DHX16O60231 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
DHX16O60231 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DHX16O60231 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
DHX16O60231 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DHX16O60231 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DHX16O60231 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DHX16O60231 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
DHX16O60231 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DHX16O60231 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
DHX16O60231 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DHX16O60231 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DHX16O60231 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DHX16O60231 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DHX16O60231 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DHX16O60231 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DHX16O60231 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DHX16O60231 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DHX16O60231 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DHX16O60231 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DHX16O60231 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DHX16O60231 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DHX16O60231 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DHX16O60231 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DHX16O60231 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DHX16O60231 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DHX16O60231 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DHX16O60231 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
DHX16O60231 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DHX16O60231 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DHX16O60231 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DHX16O60231 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DHX16O60231 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DHX16O60231 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DHX16O60231 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DHX16O60231 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DHX16O60231 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DHX16O60231 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DHX16O60231 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DHX16O60231 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
DHX16O60231 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DHX16O60231 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DHX16O60231 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
DHX16O60231 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DHX16O60231 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DHX16O60231 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DHX16O60231 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DHX16O60231 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
DHX16O60231 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DHX16O60231 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DHX16O60231 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DHX16O60231 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DHX16O60231 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DHX16O60231 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
DHX16O60231 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DHX16O60231 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DHX16O60231 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
DHX16O60231 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DHX16O60231 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DHX16O60231 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DHX16O60231 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
DHX16O60231 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DHX16O60231 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DHX16O60231 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DHX16O60231 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DHX16O60231 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DHX16O60231 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DHX16O60231 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
DHX16O60231 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
DHX16O60231 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DHX16O60231 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
DHX16O60231 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
DHX16O60231 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
DHX16O60231 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
DHX16O60231 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.3 ms