Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RngttO55236 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RngttO55236 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RngttO55236 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RngttO55236 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RngttO55236 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RngttO55236 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RngttO55236 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RngttO55236 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RngttO55236 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RngttO55236 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RngttO55236 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RngttO55236 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RngttO55236 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RngttO55236 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RngttO55236 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RngttO55236 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RngttO55236 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RngttO55236 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RngttO55236 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RngttO55236 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RngttO55236 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RngttO55236 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RngttO55236 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RngttO55236 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RngttO55236 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RngttO55236 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RngttO55236 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RngttO55236 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RngttO55236 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RngttO55236 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RngttO55236 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RngttO55236 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RngttO55236 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RngttO55236 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RngttO55236 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RngttO55236 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RngttO55236 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RngttO55236 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RngttO55236 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RngttO55236 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RngttO55236 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RngttO55236 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RngttO55236 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RngttO55236 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RngttO55236 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RngttO55236 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RngttO55236 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RngttO55236 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RngttO55236 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RngttO55236 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RngttO55236 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RngttO55236 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RngttO55236 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RngttO55236 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RngttO55236 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RngttO55236 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RngttO55236 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RngttO55236 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RngttO55236 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RngttO55236 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RngttO55236 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RngttO55236 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RngttO55236 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RngttO55236 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RngttO55236 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RngttO55236 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RngttO55236 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RngttO55236 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RngttO55236 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RngttO55236 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RngttO55236 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RngttO55236 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RngttO55236 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RngttO55236 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RngttO55236 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RngttO55236 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RngttO55236 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RngttO55236 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RngttO55236 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RngttO55236 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RngttO55236 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RngttO55236 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RngttO55236 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RngttO55236 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RngttO55236 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RngttO55236 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RngttO55236 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RngttO55236 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RngttO55236 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RngttO55236 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RngttO55236 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RngttO55236 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RngttO55236 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RngttO55236 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RngttO55236 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RngttO55236 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RngttO55236 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RngttO55236 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RngttO55236 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms