Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Atp2a2O55143 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Atp2a2O55143 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Atp2a2O55143 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Atp2a2O55143 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Atp2a2O55143 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms