Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ptpn20O55082 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ptpn20O55082 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ptpn20O55082 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ptpn20O55082 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms