Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SlkO54988 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SlkO54988 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SlkO54988 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SlkO54988 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SlkO54988 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SlkO54988 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SlkO54988 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SlkO54988 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SlkO54988 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SlkO54988 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SlkO54988 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SlkO54988 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SlkO54988 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SlkO54988 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SlkO54988 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SlkO54988 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SlkO54988 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SlkO54988 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SlkO54988 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SlkO54988 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SlkO54988 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SlkO54988 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SlkO54988 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SlkO54988 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SlkO54988 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SlkO54988 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SlkO54988 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SlkO54988 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SlkO54988 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SlkO54988 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SlkO54988 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SlkO54988 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SlkO54988 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SlkO54988 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SlkO54988 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SlkO54988 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SlkO54988 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SlkO54988 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SlkO54988 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SlkO54988 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SlkO54988 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SlkO54988 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SlkO54988 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SlkO54988 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SlkO54988 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SlkO54988 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SlkO54988 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SlkO54988 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SlkO54988 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SlkO54988 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SlkO54988 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SlkO54988 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SlkO54988 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SlkO54988 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SlkO54988 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SlkO54988 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SlkO54988 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SlkO54988 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SlkO54988 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SlkO54988 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SlkO54988 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SlkO54988 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SlkO54988 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SlkO54988 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SlkO54988 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SlkO54988 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SlkO54988 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SlkO54988 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SlkO54988 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SlkO54988 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SlkO54988 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SlkO54988 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SlkO54988 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SlkO54988 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SlkO54988 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SlkO54988 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SlkO54988 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SlkO54988 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SlkO54988 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SlkO54988 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SlkO54988 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SlkO54988 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SlkO54988 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SlkO54988 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SlkO54988 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SlkO54988 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SlkO54988 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SlkO54988 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SlkO54988 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SlkO54988 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SlkO54988 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SlkO54988 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SlkO54988 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SlkO54988 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SlkO54988 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SlkO54988 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SlkO54988 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SlkO54988 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SlkO54988 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms