Protein–RNA interactions for Protein: O54962

Banf1, Barrier-to-autointegration factor, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Banf1O54962 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Banf1O54962 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Banf1O54962 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Banf1O54962 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Banf1O54962 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Banf1O54962 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Banf1O54962 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Banf1O54962 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Banf1O54962 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Banf1O54962 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Banf1O54962 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Banf1O54962 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Banf1O54962 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Banf1O54962 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Banf1O54962 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Banf1O54962 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Banf1O54962 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Banf1O54962 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Banf1O54962 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Banf1O54962 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Banf1O54962 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Banf1O54962 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Banf1O54962 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Banf1O54962 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Banf1O54962 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Banf1O54962 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Banf1O54962 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Banf1O54962 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Banf1O54962 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Banf1O54962 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Banf1O54962 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Banf1O54962 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Banf1O54962 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Banf1O54962 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Banf1O54962 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Banf1O54962 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Banf1O54962 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Banf1O54962 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Banf1O54962 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Banf1O54962 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Banf1O54962 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Banf1O54962 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Banf1O54962 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Banf1O54962 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Banf1O54962 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Banf1O54962 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Banf1O54962 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Banf1O54962 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Banf1O54962 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Banf1O54962 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Banf1O54962 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Banf1O54962 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Banf1O54962 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Banf1O54962 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Banf1O54962 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Banf1O54962 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Banf1O54962 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Banf1O54962 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Banf1O54962 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Banf1O54962 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Banf1O54962 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Banf1O54962 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Banf1O54962 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms