Protein–RNA interactions for Protein: O54946

Dnajb6, DnaJ homolog subfamily B member 6, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajb6O54946 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Dnajb6O54946 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Dnajb6O54946 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Dnajb6O54946 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Dnajb6O54946 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnajb6O54946 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnajb6O54946 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnajb6O54946 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dnajb6O54946 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnajb6O54946 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 586.4 ms