Protein–RNA interactions for Protein: O54942

Cldn5, Claudin-5, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn5O54942 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cldn5O54942 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cldn5O54942 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cldn5O54942 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cldn5O54942 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cldn5O54942 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cldn5O54942 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cldn5O54942 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cldn5O54942 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cldn5O54942 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cldn5O54942 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn5O54942 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cldn5O54942 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cldn5O54942 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldn5O54942 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldn5O54942 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldn5O54942 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldn5O54942 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldn5O54942 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldn5O54942 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cldn5O54942 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cldn5O54942 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Cldn5O54942 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn5O54942 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn5O54942 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn5O54942 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cldn5O54942 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cldn5O54942 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cldn5O54942 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cldn5O54942 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn5O54942 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cldn5O54942 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn5O54942 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cldn5O54942 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cldn5O54942 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cldn5O54942 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn5O54942 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn5O54942 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn5O54942 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cldn5O54942 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn5O54942 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cldn5O54942 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms