Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Socs5O54928 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Socs5O54928 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Socs5O54928 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Socs5O54928 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Socs5O54928 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Socs5O54928 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Socs5O54928 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Socs5O54928 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Socs5O54928 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Socs5O54928 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Socs5O54928 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Socs5O54928 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Socs5O54928 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Socs5O54928 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Socs5O54928 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Socs5O54928 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Socs5O54928 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Socs5O54928 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Socs5O54928 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Socs5O54928 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Socs5O54928 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Socs5O54928 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Socs5O54928 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Socs5O54928 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Socs5O54928 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Socs5O54928 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Socs5O54928 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Socs5O54928 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Socs5O54928 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Socs5O54928 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Socs5O54928 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Socs5O54928 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Socs5O54928 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Socs5O54928 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Socs5O54928 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Socs5O54928 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Socs5O54928 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Socs5O54928 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Socs5O54928 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Socs5O54928 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Socs5O54928 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Socs5O54928 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Socs5O54928 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Socs5O54928 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Socs5O54928 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Socs5O54928 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Socs5O54928 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Socs5O54928 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms