Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DffaO54786 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DffaO54786 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DffaO54786 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DffaO54786 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DffaO54786 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DffaO54786 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DffaO54786 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DffaO54786 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DffaO54786 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DffaO54786 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DffaO54786 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DffaO54786 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DffaO54786 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DffaO54786 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DffaO54786 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DffaO54786 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DffaO54786 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DffaO54786 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DffaO54786 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DffaO54786 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DffaO54786 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DffaO54786 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DffaO54786 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DffaO54786 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DffaO54786 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DffaO54786 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DffaO54786 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DffaO54786 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DffaO54786 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DffaO54786 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DffaO54786 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DffaO54786 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DffaO54786 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DffaO54786 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DffaO54786 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DffaO54786 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DffaO54786 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DffaO54786 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DffaO54786 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DffaO54786 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DffaO54786 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DffaO54786 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DffaO54786 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DffaO54786 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
DffaO54786 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DffaO54786 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DffaO54786 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DffaO54786 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DffaO54786 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DffaO54786 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DffaO54786 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DffaO54786 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DffaO54786 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DffaO54786 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DffaO54786 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DffaO54786 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DffaO54786 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DffaO54786 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DffaO54786 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DffaO54786 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DffaO54786 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DffaO54786 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DffaO54786 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
DffaO54786 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DffaO54786 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DffaO54786 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DffaO54786 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DffaO54786 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DffaO54786 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DffaO54786 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DffaO54786 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DffaO54786 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DffaO54786 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DffaO54786 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DffaO54786 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DffaO54786 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DffaO54786 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DffaO54786 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DffaO54786 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DffaO54786 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DffaO54786 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DffaO54786 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DffaO54786 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DffaO54786 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DffaO54786 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DffaO54786 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DffaO54786 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DffaO54786 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DffaO54786 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DffaO54786 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DffaO54786 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DffaO54786 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
DffaO54786 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DffaO54786 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
DffaO54786 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
DffaO54786 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DffaO54786 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
DffaO54786 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
DffaO54786 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms