Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cavin1O54724 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cavin1O54724 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cavin1O54724 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cavin1O54724 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cavin1O54724 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cavin1O54724 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cavin1O54724 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cavin1O54724 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cavin1O54724 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cavin1O54724 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cavin1O54724 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cavin1O54724 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cavin1O54724 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cavin1O54724 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cavin1O54724 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cavin1O54724 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cavin1O54724 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cavin1O54724 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cavin1O54724 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cavin1O54724 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cavin1O54724 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cavin1O54724 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cavin1O54724 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms