Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYNGR3O43761 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYNGR3O43761 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYNGR3O43761 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYNGR3O43761 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 473.7 ms