Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN6O43657 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN6O43657 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN6O43657 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN6O43657 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN6O43657 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN6O43657 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN6O43657 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN6O43657 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN6O43657 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN6O43657 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN6O43657 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN6O43657 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN6O43657 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN6O43657 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN6O43657 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN6O43657 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN6O43657 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN6O43657 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN6O43657 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TSPAN6O43657 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TSPAN6O43657 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TSPAN6O43657 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms