Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENRO43583 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENRO43583 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENRO43583 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENRO43583 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DENRO43583 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENRO43583 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENRO43583 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DENRO43583 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DENRO43583 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENRO43583 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DENRO43583 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENRO43583 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENRO43583 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DENRO43583 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DENRO43583 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DENRO43583 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DENRO43583 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DENRO43583 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DENRO43583 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DENRO43583 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DENRO43583 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DENRO43583 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DENRO43583 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENRO43583 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENRO43583 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENRO43583 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENRO43583 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENRO43583 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENRO43583 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DENRO43583 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DENRO43583 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENRO43583 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENRO43583 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DENRO43583 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENRO43583 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DENRO43583 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENRO43583 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DENRO43583 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENRO43583 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENRO43583 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENRO43583 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENRO43583 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENRO43583 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DENRO43583 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DENRO43583 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENRO43583 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DENRO43583 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENRO43583 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENRO43583 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENRO43583 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENRO43583 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENRO43583 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DENRO43583 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DENRO43583 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENRO43583 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DENRO43583 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENRO43583 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENRO43583 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
DENRO43583 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
DENRO43583 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENRO43583 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENRO43583 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENRO43583 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
DENRO43583 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENRO43583 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
DENRO43583 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENRO43583 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENRO43583 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENRO43583 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENRO43583 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
DENRO43583 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DENRO43583 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENRO43583 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENRO43583 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DENRO43583 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENRO43583 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENRO43583 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENRO43583 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENRO43583 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DENRO43583 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DENRO43583 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENRO43583 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENRO43583 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENRO43583 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENRO43583 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENRO43583 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DENRO43583 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENRO43583 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENRO43583 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENRO43583 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DENRO43583 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENRO43583 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DENRO43583 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENRO43583 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENRO43583 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENRO43583 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DENRO43583 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
DENRO43583 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DENRO43583 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms