Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SMAD6O43541 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMAD6O43541 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMAD6O43541 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SMAD6O43541 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms