Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
KCNQ2O43526 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
KCNQ2O43526 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KCNQ2O43526 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
KCNQ2O43526 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
KCNQ2O43526 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KCNQ2O43526 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KCNQ2O43526 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KCNQ2O43526 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KCNQ2O43526 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KCNQ2O43526 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
KCNQ2O43526 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
KCNQ2O43526 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KCNQ2O43526 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KCNQ2O43526 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
KCNQ2O43526 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KCNQ2O43526 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KCNQ2O43526 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KCNQ2O43526 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KCNQ2O43526 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KCNQ2O43526 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KCNQ2O43526 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
KCNQ2O43526 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KCNQ2O43526 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KCNQ2O43526 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KCNQ2O43526 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KCNQ2O43526 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KCNQ2O43526 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KCNQ2O43526 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KCNQ2O43526 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KCNQ2O43526 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KCNQ2O43526 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KCNQ2O43526 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
KCNQ2O43526 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KCNQ2O43526 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
KCNQ2O43526 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KCNQ2O43526 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KCNQ2O43526 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KCNQ2O43526 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
KCNQ2O43526 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KCNQ2O43526 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KCNQ2O43526 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
KCNQ2O43526 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KCNQ2O43526 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
KCNQ2O43526 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
KCNQ2O43526 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KCNQ2O43526 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KCNQ2O43526 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
KCNQ2O43526 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KCNQ2O43526 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
KCNQ2O43526 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
KCNQ2O43526 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KCNQ2O43526 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
KCNQ2O43526 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KCNQ2O43526 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KCNQ2O43526 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
KCNQ2O43526 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KCNQ2O43526 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
KCNQ2O43526 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
KCNQ2O43526 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
KCNQ2O43526 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KCNQ2O43526 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
KCNQ2O43526 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KCNQ2O43526 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
KCNQ2O43526 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KCNQ2O43526 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KCNQ2O43526 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KCNQ2O43526 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
KCNQ2O43526 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
KCNQ2O43526 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
KCNQ2O43526 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
KCNQ2O43526 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
KCNQ2O43526 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms