Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KCNQ3O43525 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KCNQ3O43525 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KCNQ3O43525 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KCNQ3O43525 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KCNQ3O43525 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KCNQ3O43525 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KCNQ3O43525 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KCNQ3O43525 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KCNQ3O43525 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
KCNQ3O43525 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KCNQ3O43525 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KCNQ3O43525 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
KCNQ3O43525 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KCNQ3O43525 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KCNQ3O43525 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KCNQ3O43525 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KCNQ3O43525 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KCNQ3O43525 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KCNQ3O43525 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KCNQ3O43525 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KCNQ3O43525 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
KCNQ3O43525 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KCNQ3O43525 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
KCNQ3O43525 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KCNQ3O43525 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KCNQ3O43525 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KCNQ3O43525 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
KCNQ3O43525 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KCNQ3O43525 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KCNQ3O43525 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KCNQ3O43525 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KCNQ3O43525 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KCNQ3O43525 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KCNQ3O43525 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KCNQ3O43525 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KCNQ3O43525 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KCNQ3O43525 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KCNQ3O43525 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
KCNQ3O43525 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
KCNQ3O43525 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
KCNQ3O43525 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KCNQ3O43525 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KCNQ3O43525 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
KCNQ3O43525 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
KCNQ3O43525 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KCNQ3O43525 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KCNQ3O43525 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KCNQ3O43525 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KCNQ3O43525 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KCNQ3O43525 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
KCNQ3O43525 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
KCNQ3O43525 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KCNQ3O43525 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KCNQ3O43525 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KCNQ3O43525 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KCNQ3O43525 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms