Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K13O43283 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K13O43283 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MAP3K13O43283 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K13O43283 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MAP3K13O43283 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K13O43283 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MAP3K13O43283 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K13O43283 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K13O43283 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K13O43283 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K13O43283 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K13O43283 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MAP3K13O43283 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K13O43283 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K13O43283 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MAP3K13O43283 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAP3K13O43283 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAP3K13O43283 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MAP3K13O43283 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MAP3K13O43283 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MAP3K13O43283 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MAP3K13O43283 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms