Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC11O43248 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC11O43248 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC11O43248 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC11O43248 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC11O43248 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC11O43248 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC11O43248 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC11O43248 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC11O43248 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC11O43248 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC11O43248 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
HOXC11O43248 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXC11O43248 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXC11O43248 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms