Protein–RNA interactions for Protein: O43175

PHGDH, D-3-phosphoglycerate dehydrogenase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHGDHO43175 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PHGDHO43175 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PHGDHO43175 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PHGDHO43175 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PHGDHO43175 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PHGDHO43175 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms