Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PJA2O43164 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PJA2O43164 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PJA2O43164 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PJA2O43164 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PJA2O43164 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PJA2O43164 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PJA2O43164 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PJA2O43164 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PJA2O43164 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PJA2O43164 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PJA2O43164 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PJA2O43164 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PJA2O43164 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PJA2O43164 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PJA2O43164 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PJA2O43164 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PJA2O43164 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PJA2O43164 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PJA2O43164 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PJA2O43164 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PJA2O43164 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PJA2O43164 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PJA2O43164 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PJA2O43164 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PJA2O43164 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PJA2O43164 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PJA2O43164 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PJA2O43164 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PJA2O43164 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PJA2O43164 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PJA2O43164 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PJA2O43164 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PJA2O43164 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PJA2O43164 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PJA2O43164 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PJA2O43164 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PJA2O43164 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PJA2O43164 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PJA2O43164 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PJA2O43164 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PJA2O43164 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PJA2O43164 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PJA2O43164 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PJA2O43164 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PJA2O43164 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PJA2O43164 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PJA2O43164 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PJA2O43164 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PJA2O43164 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PJA2O43164 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PJA2O43164 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PJA2O43164 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PJA2O43164 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PJA2O43164 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PJA2O43164 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PJA2O43164 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PJA2O43164 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PJA2O43164 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PJA2O43164 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PJA2O43164 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PJA2O43164 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PJA2O43164 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PJA2O43164 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PJA2O43164 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PJA2O43164 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PJA2O43164 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PJA2O43164 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PJA2O43164 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PJA2O43164 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PJA2O43164 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PJA2O43164 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PJA2O43164 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PJA2O43164 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PJA2O43164 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PJA2O43164 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PJA2O43164 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PJA2O43164 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PJA2O43164 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PJA2O43164 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PJA2O43164 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PJA2O43164 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PJA2O43164 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PJA2O43164 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PJA2O43164 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PJA2O43164 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PJA2O43164 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PJA2O43164 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PJA2O43164 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PJA2O43164 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PJA2O43164 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PJA2O43164 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PJA2O43164 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PJA2O43164 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PJA2O43164 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PJA2O43164 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PJA2O43164 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PJA2O43164 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PJA2O43164 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PJA2O43164 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms