Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PLXNB1O43157 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PLXNB1O43157 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PLXNB1O43157 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PLXNB1O43157 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.6 ms