Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Phox2bO35690 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Phox2bO35690 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Phox2bO35690 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Phox2bO35690 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Phox2bO35690 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phox2bO35690 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Phox2bO35690 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phox2bO35690 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phox2bO35690 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Phox2bO35690 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phox2bO35690 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Phox2bO35690 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Phox2bO35690 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phox2bO35690 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phox2bO35690 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phox2bO35690 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Phox2bO35690 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phox2bO35690 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Phox2bO35690 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Phox2bO35690 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Phox2bO35690 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phox2bO35690 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Phox2bO35690 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phox2bO35690 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Phox2bO35690 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Phox2bO35690 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Phox2bO35690 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Phox2bO35690 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phox2bO35690 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phox2bO35690 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phox2bO35690 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phox2bO35690 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Phox2bO35690 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Phox2bO35690 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phox2bO35690 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Phox2bO35690 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Phox2bO35690 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Phox2bO35690 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phox2bO35690 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phox2bO35690 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Phox2bO35690 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Phox2bO35690 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Phox2bO35690 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Phox2bO35690 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Phox2bO35690 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phox2bO35690 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phox2bO35690 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phox2bO35690 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phox2bO35690 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Phox2bO35690 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phox2bO35690 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Phox2bO35690 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Phox2bO35690 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms