Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Foxd2O35392 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Foxd2O35392 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Foxd2O35392 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Foxd2O35392 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxd2O35392 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Foxd2O35392 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd2O35392 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd2O35392 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd2O35392 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd2O35392 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd2O35392 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Foxd2O35392 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxd2O35392 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Foxd2O35392 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxd2O35392 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxd2O35392 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxd2O35392 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Foxd2O35392 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd2O35392 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd2O35392 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Foxd2O35392 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Foxd2O35392 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd2O35392 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Foxd2O35392 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Foxd2O35392 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxd2O35392 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxd2O35392 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Foxd2O35392 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd2O35392 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd2O35392 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd2O35392 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd2O35392 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd2O35392 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd2O35392 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd2O35392 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd2O35392 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd2O35392 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd2O35392 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Foxd2O35392 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms