Protein–RNA interactions for Protein: O35261

E2f3, Transcription factor E2F3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f3O35261 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f3O35261 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
E2f3O35261 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2f3O35261 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2f3O35261 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2f3O35261 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
E2f3O35261 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f3O35261 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2f3O35261 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f3O35261 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f3O35261 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f3O35261 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2f3O35261 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f3O35261 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f3O35261 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2f3O35261 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f3O35261 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f3O35261 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
E2f3O35261 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2f3O35261 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2f3O35261 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
E2f3O35261 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f3O35261 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f3O35261 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2f3O35261 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f3O35261 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f3O35261 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f3O35261 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f3O35261 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
E2f3O35261 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2f3O35261 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2f3O35261 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f3O35261 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f3O35261 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f3O35261 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f3O35261 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f3O35261 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f3O35261 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f3O35261 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2f3O35261 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2f3O35261 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2f3O35261 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f3O35261 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2f3O35261 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2f3O35261 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms