Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpaO35216 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CenpaO35216 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpaO35216 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CenpaO35216 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CenpaO35216 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpaO35216 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpaO35216 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CenpaO35216 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CenpaO35216 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CenpaO35216 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CenpaO35216 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CenpaO35216 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CenpaO35216 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CenpaO35216 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CenpaO35216 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CenpaO35216 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CenpaO35216 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CenpaO35216 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms