Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtgisO35074 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PtgisO35074 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtgisO35074 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtgisO35074 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PtgisO35074 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PtgisO35074 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtgisO35074 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PtgisO35074 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PtgisO35074 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PtgisO35074 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtgisO35074 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtgisO35074 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtgisO35074 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PtgisO35074 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtgisO35074 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PtgisO35074 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtgisO35074 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtgisO35074 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PtgisO35074 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtgisO35074 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtgisO35074 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PtgisO35074 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PtgisO35074 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PtgisO35074 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PtgisO35074 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtgisO35074 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtgisO35074 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtgisO35074 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PtgisO35074 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtgisO35074 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtgisO35074 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PtgisO35074 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PtgisO35074 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtgisO35074 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtgisO35074 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PtgisO35074 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PtgisO35074 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtgisO35074 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PtgisO35074 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PtgisO35074 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtgisO35074 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtgisO35074 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PtgisO35074 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtgisO35074 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtgisO35074 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtgisO35074 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtgisO35074 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PtgisO35074 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtgisO35074 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms