Protein–RNA interactions for Protein: O15514

POLR2D, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2DO15514 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
POLR2DO15514 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR2DO15514 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR2DO15514 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR2DO15514 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR2DO15514 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR2DO15514 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR2DO15514 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR2DO15514 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR2DO15514 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR2DO15514 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR2DO15514 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR2DO15514 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR2DO15514 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR2DO15514 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR2DO15514 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR2DO15514 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
POLR2DO15514 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
POLR2DO15514 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
POLR2DO15514 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLR2DO15514 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms