Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLGNO14967 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLGNO14967 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLGNO14967 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CLGNO14967 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLGNO14967 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLGNO14967 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLGNO14967 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLGNO14967 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLGNO14967 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLGNO14967 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLGNO14967 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CLGNO14967 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLGNO14967 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLGNO14967 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLGNO14967 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CLGNO14967 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLGNO14967 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLGNO14967 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLGNO14967 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLGNO14967 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLGNO14967 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLGNO14967 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLGNO14967 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLGNO14967 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLGNO14967 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLGNO14967 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLGNO14967 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLGNO14967 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLGNO14967 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLGNO14967 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLGNO14967 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLGNO14967 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLGNO14967 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLGNO14967 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLGNO14967 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLGNO14967 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLGNO14967 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLGNO14967 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLGNO14967 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLGNO14967 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLGNO14967 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CLGNO14967 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLGNO14967 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLGNO14967 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLGNO14967 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLGNO14967 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLGNO14967 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLGNO14967 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLGNO14967 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLGNO14967 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CLGNO14967 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLGNO14967 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLGNO14967 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLGNO14967 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLGNO14967 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLGNO14967 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLGNO14967 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLGNO14967 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CLGNO14967 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLGNO14967 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLGNO14967 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLGNO14967 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLGNO14967 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLGNO14967 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLGNO14967 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLGNO14967 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLGNO14967 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CLGNO14967 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLGNO14967 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLGNO14967 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CLGNO14967 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLGNO14967 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLGNO14967 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLGNO14967 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLGNO14967 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLGNO14967 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLGNO14967 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLGNO14967 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLGNO14967 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLGNO14967 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLGNO14967 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLGNO14967 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLGNO14967 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLGNO14967 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLGNO14967 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLGNO14967 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLGNO14967 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLGNO14967 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLGNO14967 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLGNO14967 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLGNO14967 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLGNO14967 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLGNO14967 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLGNO14967 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLGNO14967 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLGNO14967 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLGNO14967 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLGNO14967 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLGNO14967 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms