Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IKBKBO14920 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IKBKBO14920 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IKBKBO14920 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IKBKBO14920 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IKBKBO14920 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms