Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BCKDKO14874 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BCKDKO14874 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BCKDKO14874 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCKDKO14874 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms