Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDC80O14777 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDC80O14777 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDC80O14777 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDC80O14777 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDC80O14777 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NDC80O14777 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
NDC80O14777 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDC80O14777 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDC80O14777 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDC80O14777 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDC80O14777 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NDC80O14777 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDC80O14777 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDC80O14777 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDC80O14777 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDC80O14777 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDC80O14777 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDC80O14777 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDC80O14777 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDC80O14777 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDC80O14777 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDC80O14777 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDC80O14777 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDC80O14777 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDC80O14777 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDC80O14777 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDC80O14777 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDC80O14777 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDC80O14777 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDC80O14777 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDC80O14777 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
NDC80O14777 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDC80O14777 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDC80O14777 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDC80O14777 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDC80O14777 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDC80O14777 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NDC80O14777 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDC80O14777 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDC80O14777 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDC80O14777 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDC80O14777 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDC80O14777 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDC80O14777 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDC80O14777 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NDC80O14777 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDC80O14777 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDC80O14777 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
NDC80O14777 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDC80O14777 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDC80O14777 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDC80O14777 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDC80O14777 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDC80O14777 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDC80O14777 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDC80O14777 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDC80O14777 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDC80O14777 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDC80O14777 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NDC80O14777 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDC80O14777 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDC80O14777 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDC80O14777 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDC80O14777 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDC80O14777 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NDC80O14777 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDC80O14777 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NDC80O14777 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDC80O14777 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDC80O14777 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NDC80O14777 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NDC80O14777 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDC80O14777 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDC80O14777 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDC80O14777 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDC80O14777 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDC80O14777 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDC80O14777 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDC80O14777 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDC80O14777 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDC80O14777 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDC80O14777 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDC80O14777 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NDC80O14777 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDC80O14777 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDC80O14777 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NDC80O14777 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDC80O14777 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDC80O14777 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDC80O14777 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NDC80O14777 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDC80O14777 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDC80O14777 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NDC80O14777 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDC80O14777 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDC80O14777 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NDC80O14777 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDC80O14777 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NDC80O14777 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms