Protein–RNA interactions for Protein: O14613

CDC42EP2, Cdc42 effector protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP2O14613 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDC42EP2O14613 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDC42EP2O14613 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CDC42EP2O14613 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDC42EP2O14613 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms