Protein–RNA interactions for Protein: O14594

NCAN, Neurocan core protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCANO14594 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCANO14594 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NCANO14594 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NCANO14594 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCANO14594 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NCANO14594 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCANO14594 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NCANO14594 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCANO14594 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCANO14594 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NCANO14594 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCANO14594 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCANO14594 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCANO14594 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCANO14594 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCANO14594 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NCANO14594 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCANO14594 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCANO14594 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NCANO14594 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NCANO14594 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NCANO14594 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCANO14594 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCANO14594 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCANO14594 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCANO14594 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCANO14594 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCANO14594 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCANO14594 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCANO14594 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCANO14594 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCANO14594 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NCANO14594 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NCANO14594 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCANO14594 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCANO14594 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCANO14594 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCANO14594 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCANO14594 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCANO14594 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCANO14594 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCANO14594 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCANO14594 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCANO14594 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCANO14594 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCANO14594 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCANO14594 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCANO14594 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCANO14594 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCANO14594 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NCANO14594 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCANO14594 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCANO14594 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCANO14594 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCANO14594 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NCANO14594 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NCANO14594 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCANO14594 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCANO14594 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCANO14594 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NCANO14594 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCANO14594 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCANO14594 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NCANO14594 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCANO14594 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCANO14594 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCANO14594 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCANO14594 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NCANO14594 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NCANO14594 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NCANO14594 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCANO14594 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCANO14594 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCANO14594 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCANO14594 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCANO14594 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NCANO14594 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCANO14594 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCANO14594 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NCANO14594 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCANO14594 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCANO14594 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NCANO14594 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCANO14594 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NCANO14594 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCANO14594 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCANO14594 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCANO14594 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCANO14594 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCANO14594 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCANO14594 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCANO14594 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCANO14594 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCANO14594 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCANO14594 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCANO14594 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCANO14594 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCANO14594 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCANO14594 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NCANO14594 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms