Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPEO14579 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPEO14579 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
COPEO14579 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPEO14579 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPEO14579 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPEO14579 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPEO14579 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPEO14579 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPEO14579 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPEO14579 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPEO14579 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPEO14579 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPEO14579 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPEO14579 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPEO14579 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPEO14579 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPEO14579 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPEO14579 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPEO14579 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
COPEO14579 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPEO14579 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPEO14579 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPEO14579 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
COPEO14579 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPEO14579 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
COPEO14579 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
COPEO14579 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPEO14579 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
COPEO14579 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPEO14579 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPEO14579 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
COPEO14579 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPEO14579 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
COPEO14579 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPEO14579 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPEO14579 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPEO14579 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPEO14579 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
COPEO14579 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPEO14579 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPEO14579 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPEO14579 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
COPEO14579 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPEO14579 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COPEO14579 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPEO14579 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
COPEO14579 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPEO14579 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPEO14579 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPEO14579 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPEO14579 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPEO14579 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
COPEO14579 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
COPEO14579 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPEO14579 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
COPEO14579 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPEO14579 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
COPEO14579 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPEO14579 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPEO14579 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPEO14579 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPEO14579 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPEO14579 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
COPEO14579 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPEO14579 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPEO14579 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPEO14579 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPEO14579 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPEO14579 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPEO14579 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
COPEO14579 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPEO14579 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPEO14579 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
COPEO14579 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPEO14579 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPEO14579 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPEO14579 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
COPEO14579 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPEO14579 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPEO14579 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPEO14579 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
COPEO14579 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPEO14579 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPEO14579 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPEO14579 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
COPEO14579 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPEO14579 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPEO14579 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPEO14579 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
COPEO14579 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
COPEO14579 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
COPEO14579 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
COPEO14579 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPEO14579 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COPEO14579 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPEO14579 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPEO14579 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
COPEO14579 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPEO14579 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms